More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0313 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 311 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  54.1 
 
 		 306 aa  339  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2324  helix-turn-helix domain-containing protein  55.81 
 
 		 306 aa  336  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  54.25 
 
 		 304 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2529  transcriptional regulator, AraC family  51.99 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1989  AraC family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  51.33 
 
 		 306 aa  312  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0841  transcriptional regulator, AraC family  51.32 
 
 		 302 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489932  normal  0.458947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4017  transcriptional regulator, AraC family  53.18 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176614  hitchhiker  0.00151279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3745  helix-turn-helix domain-containing protein  50.83 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  49.67 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 		 302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2468  transcriptional regulator, AraC family  50.5 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3525  transcriptional regulator, AraC family  49.19 
 
 		 305 aa  298  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6699  transcriptional regulator, AraC family  47.7 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0477  helix-turn-helix domain-containing protein  47 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2714  transcriptional regulator, AraC family  48.84 
 
 		 308 aa  292  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6274  transcriptional regulator, AraC family  48.01 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2093  transcriptional regulator, AraC family  48.33 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  47.54 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5133  transcriptional regulator, AraC family  49.16 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0705999  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6134  transcriptional regulator, AraC family  48.48 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2655  transcriptional regulator, AraC family  48.03 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.5275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2643  transcriptional regulator, AraC family  48.21 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0795381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3644  transcriptional regulator, AraC family  48.33 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2111  transcriptional regulator, AraC family  48.99 
 
 		 304 aa  285  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0317919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2347  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  48.68 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  0.205256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1767  transcriptional regulator, AraC family  49.17 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5664  transcriptional regulator, AraC family  46.01 
 
 		 305 aa  282  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.169654  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1308  helix-turn-helix domain-containing protein  47.33 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  47.23 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4380  transcriptional regulator, AraC family  45.25 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.072515  decreased coverage  0.000817798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4108  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5730  transcriptional regulator, AraC family  47.73 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.861702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3135  transcriptional regulator, AraC family  46.78 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10093  putative AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1405  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 		 305 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.099769  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  42.91 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6183  transcriptional regulator, AraC family  44.04 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0614415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  40.53 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  41.37 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1306  transcriptional regulator, AraC family  40.41 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  42.91 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2759  transcriptional regulator, AraC family  38.41 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3929  transcriptional regulator, AraC family  37.2 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4603  transcriptional regulator, AraC family  51.81 
 
 		 87 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.463016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2240  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  26.78 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0769  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636487  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1694  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3534  transcriptional regulator, AraC family  38.05 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0611769  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2696  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0485  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7190  transcriptional regulator, AraC family  23.46 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6725  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342699  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  26.37 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5517  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0042541  normal  0.0106671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4278  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3773  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.653114  normal  0.0103842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  26.1 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2958  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000611309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4701  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  38.82 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6379  transcriptional regulator, AraC family  23.41 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4620  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  38.55 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  21.77 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4042  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.600459  normal  0.0950634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>