More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3773 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3773  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.653114  normal  0.0103842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
285 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3797  transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 
293 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00910315  normal  0.099485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0938  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.210407  normal  0.519262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2958  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000611309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2115  transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3383  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 
290 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0398401  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6410  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
279 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4330  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0359782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 
274 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4030  helix-turn-helix domain-containing protein  30.24 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3768  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0826  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
282 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1447  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
282 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 
280 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 
295 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 
290 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 
289 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  24.33 
 
 
307 aa  95.9  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 
299 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 
311 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3242  helix-turn-helix domain-containing protein  28.9 
 
 
276 aa  92  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 
286 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30.74 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30.74 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30.74 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30.74 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30.74 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2211  transcriptional regulator, AraC family  36.52 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  24.33 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 
297 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 
310 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1346  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  29.69 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  29.69 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
298 aa  82  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  22.34 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  29.69 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  25.38 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
305 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4132  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2462  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529684  hitchhiker  0.000432103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0890  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.88 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  25.38 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  22.56 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  29.24 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3376  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  24.9 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  24.89 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.81 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0769  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636487  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1389  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  24.7 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2448  AraC family transcription regulator  26.48 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
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NC_002950  PG2125  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129512 
 
 
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NC_013132  Cpin_0263  transcriptional regulator, AraC family  22.26 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  29.63 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.587215 
 
 
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NC_013132  Cpin_6594  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.981144 
 
 
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NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  22.82 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
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