99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3687 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 		 718 aa  1499    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.59 
 
 		 700 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  40.53 
 
 		 708 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  42.24 
 
 		 714 aa  551  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  42.69 
 
 		 707 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  42.29 
 
 		 708 aa  551  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  42.29 
 
 		 708 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  40.53 
 
 		 708 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  40.61 
 
 		 708 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  41.14 
 
 		 723 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  41.67 
 
 		 714 aa  545  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  41.14 
 
 		 736 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  42.17 
 
 		 709 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  42.07 
 
 		 709 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  40.22 
 
 		 728 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  38.07 
 
 		 724 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  39.7 
 
 		 715 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  37.69 
 
 		 727 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  39.78 
 
 		 721 aa  488  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.05 
 
 		 735 aa  489  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  38.94 
 
 		 722 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.22 
 
 		 719 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  39.17 
 
 		 730 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  38.28 
 
 		 701 aa  472  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  38.02 
 
 		 704 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  37.52 
 
 		 733 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  37.92 
 
 		 718 aa  458  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  40.03 
 
 		 747 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  35.27 
 
 		 723 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  37.07 
 
 		 724 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  37.69 
 
 		 707 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  36.81 
 
 		 733 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  35.85 
 
 		 726 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.97 
 
 		 688 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  38.84 
 
 		 747 aa  425  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.55 
 
 		 699 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  34.52 
 
 		 740 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  37.15 
 
 		 768 aa  364  3e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  37.34 
 
 		 729 aa  363  8e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.62 
 
 		 733 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  34.07 
 
 		 730 aa  360  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  34.46 
 
 		 726 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  33.75 
 
 		 734 aa  358  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  36.11 
 
 		 729 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 729 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  34.75 
 
 		 739 aa  340  5e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  34.08 
 
 		 699 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  33.99 
 
 		 740 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  32.8 
 
 		 726 aa  337  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  34.13 
 
 		 722 aa  334  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  34.93 
 
 		 818 aa  334  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  38.9 
 
 		 701 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  35.1 
 
 		 750 aa  319  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  31.11 
 
 		 734 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  36.59 
 
 		 774 aa  317  6e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.22 
 
 		 729 aa  313  4.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  35.38 
 
 		 713 aa  313  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  34.22 
 
 		 729 aa  308  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  33.28 
 
 		 713 aa  293  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  29.84 
 
 		 743 aa  293  8e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  31.26 
 
 		 716 aa  281  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  28.57 
 
 		 730 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  30.27 
 
 		 726 aa  250  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  29.43 
 
 		 727 aa  240  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  27.07 
 
 		 530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  25.18 
 
 		 657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  25.21 
 
 		 684 aa  129  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.03 
 
 		 683 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  23.06 
 
 		 706 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.85 
 
 		 674 aa  100  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  23.39 
 
 		 675 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  24.93 
 
 		 679 aa  97.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  22.79 
 
 		 700 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  23.8 
 
 		 732 aa  94.4  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  25.83 
 
 		 669 aa  93.6  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  28.87 
 
 		 578 aa  80.9  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  23.86 
 
 		 723 aa  74.3  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  29.22 
 
 		 589 aa  72  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  25.74 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25 
 
 		 579 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  30.21 
 
 		 484 aa  67  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  25.37 
 
 		 562 aa  60.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  23.98 
 
 		 579 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  26.44 
 
 		 782 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  23.83 
 
 		 679 aa  55.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  25.55 
 
 		 824 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  26.98 
 
 		 1020 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.12 
 
 		 510 aa  54.3  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  27.17 
 
 		 555 aa  54.3  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  29.53 
 
 		 552 aa  52  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  29.53 
 
 		 552 aa  52  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  25.37 
 
 		 694 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0216  hypothetical protein  21.95 
 
 		 845 aa  48.5  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 411 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  19.74 
 
 		 505 aa  47.8  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.92 
 
 		 684 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  30.65 
 
 		 700 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  26.72 
 
 		 429 aa  44.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  25.9 
 
 		 583 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>