More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0934 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  100 
 
 		 382 aa  786    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  92.67 
 
 		 379 aa  727    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.77 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 513 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.44 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  35.03 
 
 		 855 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  30.43 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0421  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.86 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  29.14 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.17 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  34.64 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.76 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  34.64 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  33.03 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  35 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  32.93 
 
 		 772 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  26.92 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  35.33 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  30.39 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  28.44 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  37.04 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  34.43 
 
 		 588 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  35 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  34.57 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  30.48 
 
 		 471 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  32.43 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  36.14 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0006  2-alkenal reductase  31.95 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  28.95 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.59 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  27.83 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  30.27 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  31.94 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  34.69 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0384  trypsin-like serine protease  28.49 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368801  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30.3 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  34.88 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  28 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  30.3 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  29.08 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  29.08 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  27.98 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  30.22 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  27.88 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  30.22 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  30.86 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  30.86 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  26.32 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  26.64 
 
 		 502 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  32.97 
 
 		 497 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  29.15 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  25.89 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  33.16 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  31.52 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  29.58 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  28.8 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  33.33 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1285  serine protease  29.26 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  28.04 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1471  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284694  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  30.59 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  29.94 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.31 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  28.78 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  31.82 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  33.89 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  32 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  34.05 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  29.19 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  32.07 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  29.19 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  28.87 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  26.96 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  30 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.83 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  28.16 
 
 		 475 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  28.16 
 
 		 478 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  28.16 
 
 		 475 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  28.16 
 
 		 475 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  31.69 
 
 		 499 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  30.87 
 
 		 475 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  28.16 
 
 		 478 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  29.79 
 
 		 487 aa  67  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  30.09 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.87 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  30.33 
 
 		 535 aa  66.2  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  32.98 
 
 		 511 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  31.07 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  27.59 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  32.45 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  30.63 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  30.43 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  32.6 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  30.86 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  32.98 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  32.98 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.36 
 
 		 752 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  27.59 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>