More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67181 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_67181  actin cortical patch  100 
 
 
617 aa  1242    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10942  conserved hypothetical protein similar to Aip1 (Eurofung)  38.08 
 
 
607 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.578742 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06370  WD-repeat protein, putative  31.53 
 
 
607 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48381  predicted protein  28.7 
 
 
715 aa  264  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.78 
 
 
1523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.69 
 
 
1221 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.95 
 
 
1363 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  20.17 
 
 
1454 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.24 
 
 
1557 aa  95.5  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  21.99 
 
 
696 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.27 
 
 
1598 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.48 
 
 
1686 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.1 
 
 
1652 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  22.87 
 
 
1217 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.44 
 
 
924 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 
1240 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  21.13 
 
 
1416 aa  90.1  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.78 
 
 
919 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  21.27 
 
 
1399 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.94 
 
 
1868 aa  88.2  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  32.89 
 
 
657 aa  88.2  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  22.01 
 
 
1163 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.07 
 
 
1188 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  18.02 
 
 
1831 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.61 
 
 
947 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.46 
 
 
576 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.95 
 
 
1760 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.4 
 
 
1623 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.09 
 
 
1364 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.53 
 
 
1609 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  20.9 
 
 
1183 aa  84.3  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.01 
 
 
596 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.67 
 
 
930 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.97 
 
 
505 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  21.91 
 
 
1196 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  19.94 
 
 
1161 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.64 
 
 
1481 aa  81.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  19.51 
 
 
1344 aa  80.9  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  21.27 
 
 
1553 aa  80.5  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  20.07 
 
 
1552 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  19.77 
 
 
1161 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.46 
 
 
1684 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.37 
 
 
1164 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  20.44 
 
 
1357 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.94 
 
 
1236 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.73 
 
 
1661 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  21.29 
 
 
1510 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.25 
 
 
1188 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  26.05 
 
 
790 aa  76.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  21.03 
 
 
589 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.52 
 
 
1411 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.84 
 
 
1211 aa  75.5  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.72 
 
 
676 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20 
 
 
1607 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83827  predicted protein  28.44 
 
 
789 aa  75.1  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0497188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.05 
 
 
1617 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.38 
 
 
1583 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.08 
 
 
1193 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  19.77 
 
 
1856 aa  74.3  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  19.83 
 
 
1599 aa  73.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
1711 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.18 
 
 
1474 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.47 
 
 
1823 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.28 
 
 
1262 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  23.27 
 
 
826 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  25.84 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  22.17 
 
 
1443 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.2 
 
 
1208 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.14 
 
 
1267 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.47 
 
 
1190 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  23.19 
 
 
1214 aa  72  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  20.53 
 
 
1209 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.4 
 
 
1348 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.07 
 
 
1789 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  22.29 
 
 
1766 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  24.1 
 
 
782 aa  70.9  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  21.1 
 
 
1311 aa  70.9  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  21.6 
 
 
1427 aa  70.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.19 
 
 
740 aa  70.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  21.94 
 
 
1190 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  22.26 
 
 
1304 aa  70.5  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.33 
 
 
1398 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.08 
 
 
677 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.28 
 
 
1626 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  20.86 
 
 
1213 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.47 
 
 
1547 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.59 
 
 
1807 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  21.27 
 
 
551 aa  68.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  23.65 
 
 
840 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  20.38 
 
 
1367 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  21.94 
 
 
1229 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  22.15 
 
 
608 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  25 
 
 
928 aa  67.4  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.61 
 
 
630 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  21.1 
 
 
1100 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.47 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.41 
 
 
1242 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  20.32 
 
 
1901 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  20.4 
 
 
1209 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  20.33 
 
 
728 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>