224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55230 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  95.41 
 
 		 305 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  64.19 
 
 		 296 aa  324  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  54.45 
 
 		 284 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  56.8 
 
 		 269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3298  fatty acid hydroxylase  64.73 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  49.15 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  49.45 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  47.48 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  49.64 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  44.74 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  44.74 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  53.93 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  47.19 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  47.19 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  48.75 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  47.84 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  47.84 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  47.86 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  37.54 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  42.51 
 
 		 400 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  32.94 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  32.82 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  27.59 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.73 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.37 
 
 		 401 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.37 
 
 		 401 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  31.66 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  33.33 
 
 		 374 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  30.54 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  28.97 
 
 		 376 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  34.86 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  29.57 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  31.49 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  32.02 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  31.46 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  30.28 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.6 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.28 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  35.96 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  28 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  29.44 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.5 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  31.03 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.31 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.31 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.64 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.31 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  27.42 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  28.93 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  31.25 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  33.12 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  30.56 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.72 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  30.82 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.75 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  33.68 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  26.27 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  32.28 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  31.11 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  32.28 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  32.28 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  25 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  26.85 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  26.82 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  32.28 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  29.81 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  31.29 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  33.11 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  33.11 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  24.9 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  29.06 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  31.25 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  31.25 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  31.29 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  31.25 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  30.63 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  26.5 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  31.22 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  27.51 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  26.51 
 
 		 328 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  30.22 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.12 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  33.58 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  31.87 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  28.88 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  28.88 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  32.75 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  31.87 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  33.8 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  29.52 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  30.13 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  29.71 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  28.83 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  28.88 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.16 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  26.64 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  32.85 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  27.65 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  26.88 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>