More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2048 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 929 aa  1907    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  41.11 
 
 		 1146 aa  170  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  41.55 
 
 		 1273 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  38.83 
 
 		 1243 aa  168  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 		 1245 aa  164  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1245 aa  160  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  37.45 
 
 		 1294 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  35.1 
 
 		 1302 aa  157  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1221 aa  155  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  36.46 
 
 		 1202 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  37.87 
 
 		 1297 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1247 aa  139  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1314 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  36.82 
 
 		 1243 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1232 aa  134  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 1134 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1289 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 967 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 978 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1149 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1146 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1091 aa  110  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1144 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 980 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1153 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  29.69 
 
 		 708 aa  92  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.69 
 
 		 703 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 701 aa  89  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.36 
 
 		 703 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 817 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 719 aa  85.1  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 755 aa  84  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 694 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 703 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 715 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 707 aa  81.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 709 aa  80.9  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.08 
 
 		 696 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 696 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 692 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.06 
 
 		 711 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 708 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 708 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 792 aa  74.3  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 814 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 701 aa  73.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 727 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 734 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 696 aa  72.8  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.09 
 
 		 709 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 745 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 732 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 715 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 732 aa  72  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 862 aa  71.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 850 aa  71.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 730 aa  71.2  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 710 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 747 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 759 aa  70.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 		 736 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 726 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 745 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 743 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 766 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 726 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 768 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 767 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 711 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 683 aa  68.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 723 aa  68.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 733 aa  68.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 726 aa  68.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 731 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  30.74 
 
 		 689 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 748 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 734 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 734 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 736 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 723 aa  67  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 832 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 741 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 789 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 843 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 719 aa  66.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 771 aa  66.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 699 aa  65.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  35.59 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 745 aa  65.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 733 aa  65.1  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  26.79 
 
 		 728 aa  64.7  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  31.35 
 
 		 743 aa  64.7  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 714 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 732 aa  64.7  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>