183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3938 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
145 aa  288  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  72.46 
 
 
138 aa  192  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  62.76 
 
 
144 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  61.54 
 
 
145 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  71.56 
 
 
139 aa  150  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 
155 aa  147  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
142 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  53.38 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 
149 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 
153 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
141 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
162 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
151 aa  84.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  38.66 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 
277 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  39.5 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 
146 aa  66.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0718  MarR family transcriptional regulator  64.1 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  32.67 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  29.31 
 
 
214 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
303 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
173 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.11 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
160 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  29.06 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  29.76 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  32.56 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
195 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 
196 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>