More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0858 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  81.67 
 
 		 442 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  81.9 
 
 		 442 aa  735    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 442 aa  894    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  54.38 
 
 		 435 aa  484  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  54.34 
 
 		 437 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  55.02 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  53.54 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  52.05 
 
 		 436 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  52.36 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  48.02 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  50 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  46.3 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  47.89 
 
 		 449 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  48.53 
 
 		 445 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  46.38 
 
 		 448 aa  359  5e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  46.05 
 
 		 451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  47.89 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  47.39 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  44.42 
 
 		 438 aa  343  4e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  46.26 
 
 		 457 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  45.51 
 
 		 460 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  45.66 
 
 		 444 aa  328  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  46.59 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  46.95 
 
 		 441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  43.74 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  44.19 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  45.32 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  45.43 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  45.41 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  45.23 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  44.72 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  44.49 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  43.74 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  41.44 
 
 		 489 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  41.65 
 
 		 428 aa  303  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  40.7 
 
 		 457 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  45.15 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  41.37 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  40.49 
 
 		 453 aa  299  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  40.71 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  40.49 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  40.27 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  40.27 
 
 		 453 aa  292  8e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_002978  WD0981  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 453 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  42.07 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0137  tRNA modification GTPase TrmE  41.59 
 
 		 437 aa  286  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  40.13 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  40.13 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  39.82 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4256  tRNA modification GTPase TrmE  39.65 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  39.46 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 467 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 467 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 467 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0199  tRNA modification GTPase TrmE  41.88 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 455 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  38.44 
 
 		 458 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 454 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  40.76 
 
 		 448 aa  276  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  38.01 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 481 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  38.34 
 
 		 454 aa  276  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 481 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  38.66 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  37.94 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  38.7 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2757  tRNA modification GTPase TrmE  41.03 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  37.72 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>