More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3644 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3644  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
1740 aa  3450    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511908  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.09 
 
 
919 aa  176  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
1557 aa  173  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.69 
 
 
1357 aa  171  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.89 
 
 
1217 aa  170  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.18 
 
 
1211 aa  159  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.87 
 
 
1523 aa  139  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  28.41 
 
 
505 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.14 
 
 
924 aa  133  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  31.57 
 
 
1454 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5898  WD-40 repeat protein  36.54 
 
 
334 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.22 
 
 
761 aa  128  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1129  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.88 
 
 
608 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0156816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3598  WD-40 repeat protein  27.69 
 
 
774 aa  116  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.867901  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.49 
 
 
1240 aa  113  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.9 
 
 
1188 aa  111  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.83 
 
 
1760 aa  109  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  31.95 
 
 
1491 aa  109  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.62 
 
 
1344 aa  109  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.24 
 
 
1163 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.99 
 
 
1364 aa  107  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  26.24 
 
 
728 aa  107  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.29 
 
 
1367 aa  107  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.25 
 
 
1868 aa  105  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.3 
 
 
1221 aa  105  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  31.78 
 
 
1416 aa  105  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.11 
 
 
930 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.79 
 
 
1481 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.88 
 
 
675 aa  103  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.35 
 
 
1652 aa  103  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 
1474 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.33 
 
 
612 aa  100  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.59 
 
 
1510 aa  99.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.71 
 
 
1363 aa  99.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.65 
 
 
1188 aa  99.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.11 
 
 
1236 aa  99.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28.98 
 
 
1280 aa  94.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.07 
 
 
1831 aa  94.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.57 
 
 
1262 aa  94  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.51 
 
 
1193 aa  93.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.51 
 
 
947 aa  93.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 
1213 aa  92.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.58 
 
 
1807 aa  92  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.11 
 
 
1399 aa  92  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.54 
 
 
1623 aa  91.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.49 
 
 
1190 aa  91.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.45 
 
 
737 aa  91.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.54 
 
 
1484 aa  89.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.16 
 
 
1552 aa  88.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3599  hypothetical protein  26.05 
 
 
647 aa  87.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.662369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.36 
 
 
1229 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.4 
 
 
716 aa  87  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.2 
 
 
696 aa  85.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.71 
 
 
1553 aa  85.9  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.3 
 
 
1856 aa  85.5  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.59 
 
 
1016 aa  85.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  26 
 
 
1330 aa  85.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.35 
 
 
1411 aa  83.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.77 
 
 
698 aa  82.8  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.31 
 
 
1208 aa  82.8  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.31 
 
 
1684 aa  82  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  24.22 
 
 
1016 aa  82  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.66 
 
 
1196 aa  81.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.58 
 
 
1599 aa  80.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  25.19 
 
 
520 aa  80.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.3 
 
 
1161 aa  80.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  38.1 
 
 
473 aa  80.1  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.3 
 
 
1161 aa  79.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  35.16 
 
 
335 aa  79.7  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0781  WD-40 repeat protein  25.62 
 
 
711 aa  79  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.6 
 
 
676 aa  79  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  34.91 
 
 
389 aa  79  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  25.96 
 
 
652 aa  79  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.36 
 
 
1617 aa  78.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.8 
 
 
1242 aa  78.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.58 
 
 
1858 aa  78.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.91 
 
 
1214 aa  78.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  25.51 
 
 
1334 aa  77.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.89 
 
 
1607 aa  77.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.63 
 
 
1247 aa  77  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.92 
 
 
1901 aa  76.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.96 
 
 
576 aa  76.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  28.37 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.74 
 
 
828 aa  76.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.39 
 
 
1609 aa  75.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
687 aa  75.5  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  27.73 
 
 
578 aa  74.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.02 
 
 
682 aa  73.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.86 
 
 
692 aa  73.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  25.5 
 
 
774 aa  72.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.51 
 
 
657 aa  72.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.16 
 
 
682 aa  71.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  34.15 
 
 
452 aa  71.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  33 
 
 
928 aa  71.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  26.71 
 
 
346 aa  72  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  23.56 
 
 
551 aa  71.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25.38 
 
 
608 aa  71.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  25.56 
 
 
1355 aa  70.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  31.28 
 
 
405 aa  70.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  26.86 
 
 
589 aa  71.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>