295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2156 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  263  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  87.79 
 
 		 131 aa  238  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  83.21 
 
 		 131 aa  222  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  81.68 
 
 		 133 aa  217  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  80.15 
 
 		 131 aa  209  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  76.34 
 
 		 131 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  74.05 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  54.2 
 
 		 131 aa  153  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 133 aa  150  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  38.81 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  36.3 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  36.3 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  26.72 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  26.81 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  32.77 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  39.02 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  26.56 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  34.65 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  33 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  28.07 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  26.24 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  33.93 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  33.91 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  23.85 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  26.61 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  29.7 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 227 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  33.66 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  33.66 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  27.73 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  28.37 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  25.2 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 394 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  27.19 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>