More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0458 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 404 aa  804    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  63.5 
 
 		 412 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  61.58 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  58.44 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  59.64 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  61.44 
 
 		 436 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  58.51 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  55.14 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  57.69 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  55.13 
 
 		 407 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  59.27 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  58.76 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  59.04 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  56.25 
 
 		 422 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  56.38 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  51.06 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  50.27 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  51.41 
 
 		 410 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  50.13 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  51.2 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  49.1 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  52.49 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  54.08 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  50.75 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  55.56 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  49.87 
 
 		 405 aa  364  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  50.84 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  49.6 
 
 		 443 aa  359  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  50.44 
 
 		 460 aa  355  5.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  52.71 
 
 		 438 aa  354  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  50.13 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  48.94 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  48.91 
 
 		 434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  50.27 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  51.48 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  52.14 
 
 		 407 aa  346  3e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  48.32 
 
 		 407 aa  345  6e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  49.21 
 
 		 416 aa  345  8.999999999999999e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  50.26 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  54.79 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  55.95 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  54.37 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  50.3 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  44.76 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  47.62 
 
 		 410 aa  333  3e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  45.97 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  51.18 
 
 		 403 aa  332  5e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  48.42 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  48.59 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  47.23 
 
 		 413 aa  325  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  43.85 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  47.37 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  46.61 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  48.17 
 
 		 429 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  46.22 
 
 		 417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  45.25 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  56.73 
 
 		 284 aa  316  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  46.74 
 
 		 415 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  42.37 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  49.53 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  43.38 
 
 		 465 aa  305  9.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  44.29 
 
 		 464 aa  305  9.000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  43.16 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  46.11 
 
 		 431 aa  290  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  57.39 
 
 		 731 aa  261  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.71 
 
 		 731 aa  260  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  57.39 
 
 		 731 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.71 
 
 		 731 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.19 
 
 		 735 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.89 
 
 		 769 aa  254  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.98 
 
 		 679 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.36 
 
 		 757 aa  253  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.62 
 
 		 768 aa  253  4.0000000000000004e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.97 
 
 		 732 aa  253  6e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  51.18 
 
 		 641 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.55 
 
 		 719 aa  250  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  52.19 
 
 		 682 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 		 687 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 		 706 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.84 
 
 		 715 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  50.75 
 
 		 702 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.59 
 
 		 760 aa  248  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 		 639 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 		 705 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.12 
 
 		 754 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  51.59 
 
 		 654 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.51 
 
 		 727 aa  247  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.19 
 
 		 740 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.02 
 
 		 646 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  49.61 
 
 		 754 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.97 
 
 		 730 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.54 
 
 		 754 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.02 
 
 		 646 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.21 
 
 		 669 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.21 
 
 		 671 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 		 687 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  53.51 
 
 		 718 aa  243  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.62 
 
 		 662 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 		 610 aa  243  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.81 
 
 		 659 aa  243  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>