113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1409 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  80.6 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1366  putative prophage repressor  35.11 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.291481  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  27.51 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  36.69 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.24 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  26.98 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  27.19 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  27.06 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  42.22 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  45.05 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  47.62 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  30.62 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  39.24 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  46.43 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  29.77 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  36.78 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  39.71 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  30.94 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  27.66 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  37 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  24.23 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  34.88 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  37.33 
 
 		 144 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.83 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  27.36 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  27.36 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  27.36 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  33.33 
 
 		 263 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  38.89 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1892  transcriptional regulator, XRE family  31.61 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  26 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  25.66 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  36.96 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  34.51 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  36.63 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  40.62 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  32.58 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  26.57 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  32.58 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  33.33 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  26.8 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  30.48 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  35.63 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1416  putative phage repressor  36.05 
 
 		 100 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  28.5 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1993  peptidase S24 and S26 domain-containing protein  29.02 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  38.27 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  30.33 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  30.33 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  37.39 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.3 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  38.2 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  32 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  25.23 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1049  peptidase S24, S26A and S26B  29.52 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.140554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  28.35 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  34.78 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  31.91 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  34.48 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  35.65 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  35.8 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  34.48 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  35 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  36.51 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.65 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  38.89 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  42.03 
 
 		 110 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  29.81 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  25.31 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.46 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.92 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  43.94 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  34.19 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.78 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  35.23 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  32.14 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  32.14 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.98 
 
 		 132 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  31.43 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  34.78 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  29.03 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  32.99 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  25.26 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  30.9 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  31.11 
 
 		 230 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  34.78 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  31.11 
 
 		 230 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  31.11 
 
 		 230 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  32.61 
 
 		 270 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>