36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0872 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  100 
 
 
110 aa  216  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1526  peptidase S26 family protein  61.76 
 
 
127 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  49.46 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0892  hypothetical protein  41.3 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3686  putative phage repressor  45.16 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17151  putative signal peptidase  40.62 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.639188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  46.15 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0567  putative phage repressor  40.66 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.84818  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1726  peptidase S24, S26A and S26B  40.62 
 
 
113 aa  57.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0862  signal peptidase I  38.27 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.187229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4175  putative phage repressor  39.74 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13421  putative signal peptidase  35.23 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14561  putative signal peptidase  27.59 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19741  putative signal peptidase  41.76 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0299302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2043  folylpolyglutamate synthetase  37.23 
 
 
241 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  40 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  43.24 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3696  peptidase S24, S26A and S26B  41.57 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87177  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  27.05 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1391  hypothetical protein  32.56 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.662224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6281  putative phage repressor  41.56 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18480  Peptidase S24-like protein  35.35 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.333432  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0978  putative phage repressor  39.13 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14941  putative signal peptidase  30.23 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.258395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8300  nner membrane protease subunit 1-like protein  37.63 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2560  hypothetical protein  34.96 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  42.03 
 
 
210 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  24.22 
 
 
186 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  40.58 
 
 
283 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  28.24 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14801  putative signal peptidase  29.07 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  37.68 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0610  putative phage repressor  32.58 
 
 
134 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.719014  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  37.97 
 
 
216 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  32.26 
 
 
686 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06841  mitochondrial inner membrane protease subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12820)  28.57 
 
 
182 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0868812  normal  0.54354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>