23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4076 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  100 
 
 
108 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3696  peptidase S24, S26A and S26B  86.54 
 
 
133 aa  173  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87177  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4175  putative phage repressor  60 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3686  putative phage repressor  52.38 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6281  putative phage repressor  48.98 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0567  putative phage repressor  48.6 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.84818  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0978  putative phage repressor  50 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  52.7 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8300  nner membrane protease subunit 1-like protein  49.46 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  53.42 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  47.37 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1726  peptidase S24, S26A and S26B  43.12 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  40.45 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1526  peptidase S26 family protein  42.67 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  31.11 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  35.94 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.452015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0892  hypothetical protein  33.7 
 
 
115 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.127933 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03149  mitochondrial inner membrane protease subunit Imp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13840)  32.09 
 
 
282 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.352834  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17151  putative signal peptidase  32.91 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.639188  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19741  putative signal peptidase  35.62 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0299302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2560  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2140  signal peptidase I  22.3 
 
 
174 aa  40.8  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  41.38 
 
 
233 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>