27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8300 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8300  nner membrane protease subunit 1-like protein  100 
 
 
101 aa  193  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  70.33 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0567  putative phage repressor  60.64 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.84818  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3686  putative phage repressor  65.59 
 
 
110 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  50 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0978  putative phage repressor  52.69 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  44.55 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  48.91 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18480  Peptidase S24-like protein  52.38 
 
 
115 aa  62.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.333432  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3696  peptidase S24, S26A and S26B  45.45 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87177  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4175  putative phage repressor  48.05 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6281  putative phage repressor  41.3 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1526  peptidase S26 family protein  38.78 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  34.85 
 
 
207 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  24.63 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1726  peptidase S24, S26A and S26B  41.05 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  31.43 
 
 
167 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.452015 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17151  putative signal peptidase  30.77 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.639188  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  34.92 
 
 
331 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  37.63 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  30.95 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 
204 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  44.44 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  40.32 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  37.5 
 
 
199 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  33.33 
 
 
235 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  43.55 
 
 
217 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.186199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>