147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2560 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2560  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  289  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7742  hypothetical protein  47.95 
 
 
173 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0855195  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4184  hypothetical protein  39.72 
 
 
174 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.693567  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5832  signal peptidase I  46.77 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3757  signal peptidase I  38.78 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  44.8 
 
 
686 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  28.27 
 
 
220 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  28.27 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  27.23 
 
 
220 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  27.75 
 
 
220 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  26.57 
 
 
349 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  27.38 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  26.57 
 
 
349 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2032  peptidase S24 and S26 domain protein  44.54 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  26.18 
 
 
220 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  25.93 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  35.83 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.452015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  29.59 
 
 
322 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  26.7 
 
 
220 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  26.7 
 
 
220 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  39.24 
 
 
232 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  26.85 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  28.03 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  29.84 
 
 
190 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1526  peptidase S26 family protein  31.97 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  26.7 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  26.17 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  35.17 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  32.11 
 
 
324 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  34 
 
 
324 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  33.33 
 
 
324 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  23.48 
 
 
198 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  34.82 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  34 
 
 
324 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  34 
 
 
324 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  26.17 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  33.33 
 
 
324 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  34 
 
 
324 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  34 
 
 
324 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  34.62 
 
 
240 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  26.17 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  26.17 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  26.17 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  23.6 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  33.64 
 
 
324 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  25.14 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  25.14 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  24.22 
 
 
173 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2135  signal peptidase I  29.8 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0591499  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  26.17 
 
 
187 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1391  hypothetical protein  20.87 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.662224  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  27.94 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  32.79 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  26.85 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  34.96 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  26.85 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  26.85 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  26.92 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  34.78 
 
 
305 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  39.29 
 
 
300 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  26.85 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  30.95 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  27.33 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  54.55 
 
 
288 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  35.44 
 
 
233 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  28.78 
 
 
304 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  52.94 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  26.92 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  28.06 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  24.21 
 
 
219 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  30.12 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0552  signal peptidase IA, inactive  21.59 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  36 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0073  signal peptidase I  21.14 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  36 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  25.58 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  28.66 
 
 
267 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  36 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  53.12 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  27.34 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  25.77 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  32.22 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  27.21 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  26.35 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  36 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  36 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  29.01 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  25.36 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  53.12 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  28.57 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  32.28 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36969  predicted protein  52.54 
 
 
223 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  27.21 
 
 
194 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1525  signal peptidase I  47.22 
 
 
258 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1516  signal peptidase I  47.22 
 
 
274 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  40.28 
 
 
325 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  40 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  27.18 
 
 
234 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  53.12 
 
 
297 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  53.12 
 
 
297 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>