29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1017 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  100 
 
 
133 aa  254  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  50 
 
 
121 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3686  putative phage repressor  48.98 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  49.46 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0978  putative phage repressor  46.08 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8300  nner membrane protease subunit 1-like protein  44.55 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18480  Peptidase S24-like protein  48.48 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.333432  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  49.44 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3696  peptidase S24, S26A and S26B  54.79 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87177  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  53.42 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0567  putative phage repressor  44.32 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.84818  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6281  putative phage repressor  41.67 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4175  putative phage repressor  50 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1726  peptidase S24, S26A and S26B  42.27 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1526  peptidase S26 family protein  37.62 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  45.33 
 
 
216 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0892  hypothetical protein  34.48 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  45.31 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17151  putative signal peptidase  32.22 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.639188  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  46.97 
 
 
235 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2560  hypothetical protein  32.79 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  31.75 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.452015 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14561  putative signal peptidase  31.65 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  43.94 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  26.76 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  39.73 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04140  peptidase, putative  31.9 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0270434  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1416  putative phage repressor  29.41 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  44.26 
 
 
225 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>