30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0978 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0978  putative phage repressor  100 
 
 
105 aa  206  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18480  Peptidase S24-like protein  53.76 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.333432  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  56.04 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0567  putative phage repressor  50 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.84818  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8300  nner membrane protease subunit 1-like protein  52.69 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  46.08 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1726  peptidase S24, S26A and S26B  47.52 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3686  putative phage repressor  52.34 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3696  peptidase S24, S26A and S26B  50.98 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6281  putative phage repressor  48.08 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  48.89 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  46.81 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0892  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  43.75 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  32.58 
 
 
207 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1416  putative phage repressor  32.22 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  39.13 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  36.78 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.452015 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  27.34 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  32.94 
 
 
217 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  46.67 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  41.67 
 
 
210 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  41.3 
 
 
216 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  29.33 
 
 
196 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  30.77 
 
 
194 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  30.77 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  28.85 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  42.22 
 
 
191 aa  40.4  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  25.55 
 
 
192 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  25.55 
 
 
193 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>