27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6281 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6281  putative phage repressor  100 
 
 		 109 aa  213  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3696  peptidase S24, S26A and S26B  48.98 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4175  putative phage repressor  51.02 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  48.89 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0978  putative phage repressor  48.08 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  41.67 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  48 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1726  peptidase S24, S26A and S26B  40.95 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8300  nner membrane protease subunit 1-like protein  41.3 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3686  putative phage repressor  45.1 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18480  Peptidase S24-like protein  45.92 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.333432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  42.11 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17151  putative signal peptidase  37.04 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.639188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1526  peptidase S26 family protein  35.09 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19741  putative signal peptidase  40 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0299302 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  41.56 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13421  putative signal peptidase  32.05 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0567  putative phage repressor  37.78 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.84818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0862  signal peptidase I  33.78 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.187229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  38.37 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  34.68 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.452015 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  34.85 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  30.43 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3987  peptidase S24, S26A and S26B  43.33 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  31.85 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  36.05 
 
 		 210 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  28.74 
 
 		 190 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>