38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1526 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1526  peptidase S26 family protein  100 
 
 
127 aa  253  7e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  61.76 
 
 
110 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19741  putative signal peptidase  47.5 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0299302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0892  hypothetical protein  39.56 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14561  putative signal peptidase  32.94 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1391  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.662224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0567  putative phage repressor  38.3 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.84818  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  40.7 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14801  putative signal peptidase  29.29 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17151  putative signal peptidase  36.46 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.639188  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14941  putative signal peptidase  30.56 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.258395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4175  putative phage repressor  40 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  37.62 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3686  putative phage repressor  36.46 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8300  nner membrane protease subunit 1-like protein  38.78 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6281  putative phage repressor  35.09 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  25.76 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  42.67 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3696  peptidase S24, S26A and S26B  39.13 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87177  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1726  peptidase S24, S26A and S26B  37.14 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2560  hypothetical protein  31.97 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0862  signal peptidase I  39.66 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.187229  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06841  mitochondrial inner membrane protease subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12820)  28.68 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0868812  normal  0.54354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0610  putative phage repressor  34.74 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.719014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
686 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04140  peptidase, putative  27.91 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0270434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  25.74 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13421  putative signal peptidase  35 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  22.06 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10934  predicted protein  29.63 
 
 
112 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.796022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  23.2 
 
 
186 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2043  folylpolyglutamate synthetase  37.5 
 
 
241 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  33.33 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  27.27 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.452015 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1741  signal peptidase I  42.22 
 
 
207 aa  40.8  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7742  hypothetical protein  32 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0855195  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  26.47 
 
 
190 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0790  Signal peptidase I  48.57 
 
 
216 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165061  hitchhiker  9.36355e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>