15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0862 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0862  signal peptidase I  100 
 
 
87 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.187229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17151  putative signal peptidase  97.7 
 
 
125 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.639188  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19741  putative signal peptidase  36.47 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0299302 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13421  putative signal peptidase  35.71 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  38.27 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1391  hypothetical protein  40.74 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.662224  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14801  putative signal peptidase  40.51 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14941  putative signal peptidase  39.51 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.258395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6281  putative phage repressor  33.78 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  34.15 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2043  folylpolyglutamate synthetase  34.41 
 
 
241 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14561  putative signal peptidase  39.51 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1526  peptidase S26 family protein  39.66 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0892  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3686  putative phage repressor  30 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>