107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2043 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2043  folylpolyglutamate synthetase  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  26.8 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  32.64 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  31.25 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  33.91 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0610  putative phage repressor  32.04 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.719014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0892  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.127933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  30.3 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  31.47 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  26.71 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  33.94 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  24.84 
 
 		 173 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3079  signal peptidase I  25.48 
 
 		 173 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  29.58 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17151  putative signal peptidase  32.48 
 
 		 125 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.639188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  37.23 
 
 		 110 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  30.53 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  28.29 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  29.5 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  27.78 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  28.47 
 
 		 185 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1136  putative phage repressor  37.04 
 
 		 101 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00114182  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  28.47 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  28.77 
 
 		 193 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  28.77 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  28.99 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  24.2 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  24.2 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0862  signal peptidase I  34.41 
 
 		 87 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.187229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  24.2 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  27.16 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3111  signal peptidase I  24.2 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.349413  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51280  predicted protein  30.11 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  30.37 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2663  signal peptidase I  28.87 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.825053  hitchhiker  0.000150203 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  24.2 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  24.2 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2801  signal peptidase I  23.57 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.18 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0292  signal peptidase I  31.58 
 
 		 432 aa  47  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  24.82 
 
 		 173 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  30.94 
 
 		 173 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  27.78 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  31.78 
 
 		 171 aa  45.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  27.03 
 
 		 187 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  27.4 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2503  signal peptidase I  27.46 
 
 		 173 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  27.78 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  27.78 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  28.17 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19741  putative signal peptidase  32.97 
 
 		 91 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0299302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  23.81 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  27.78 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  28.47 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  29.17 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  26.57 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  27.03 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  46.51 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  27.03 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  27.39 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  48.78 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  23.76 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  23.76 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  27.46 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  46.67 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13421  putative signal peptidase  36.36 
 
 		 90 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  27.03 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  46.67 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  46.67 
 
 		 325 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  42.11 
 
 		 343 aa  43.5  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  48.78 
 
 		 342 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  44.44 
 
 		 325 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  39.06 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  48.08 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  28.95 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  33.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  46.67 
 
 		 325 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  33.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  33.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  33.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  33.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  37.93 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  33.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  33.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2140  signal peptidase I  27.69 
 
 		 174 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  48.78 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  33.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  46.34 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  35.87 
 
 		 284 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  35.87 
 
 		 284 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  35.87 
 
 		 284 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  30.61 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  25.87 
 
 		 184 aa  42.4  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  46.34 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  46.67 
 
 		 324 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  27.82 
 
 		 189 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  46.34 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2661  signal peptidase I  29.01 
 
 		 138 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  37.68 
 
 		 305 aa  42  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  53.49 
 
 		 338 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>