20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1726 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1726  peptidase S24, S26A and S26B  100 
 
 
113 aa  216  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18480  Peptidase S24-like protein  49 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.333432  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0978  putative phage repressor  47.52 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7705  putative phage repressor  47.47 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  42.27 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0567  putative phage repressor  42.31 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.84818  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6281  putative phage repressor  40.95 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0872  peptidase S26 family protein  40.62 
 
 
110 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.414404  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3686  putative phage repressor  45.54 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  41.3 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8300  nner membrane protease subunit 1-like protein  41.05 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1526  peptidase S26 family protein  37.14 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3696  peptidase S24, S26A and S26B  42.16 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87177  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0610  putative phage repressor  40.59 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.719014  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10934  predicted protein  32 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.796022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  25.22 
 
 
306 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  25.22 
 
 
306 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2000  signal peptidase-related protein  51.72 
 
 
208 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  31.82 
 
 
207 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4076  putative phage repressor  37.5 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>