More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2000 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2000  signal peptidase-related protein  100 
 
 		 208 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  25.1 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  27.43 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  24.48 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  22.92 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  26.13 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  26.7 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  25.56 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  24.45 
 
 		 381 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  25.2 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  24.3 
 
 		 305 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  26.24 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  26.76 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  24.74 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  26.29 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  26.29 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  26.76 
 
 		 297 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  26.42 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  27.05 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  24.88 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  24.88 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  26.76 
 
 		 297 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  26.76 
 
 		 297 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  23.64 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  26.76 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  26.96 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  25.11 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  26.96 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  25 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  27.14 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  27.23 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  25.73 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  24.89 
 
 		 299 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  26.13 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  23.9 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  24.65 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  26.92 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  23.9 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  23.5 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  26.17 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  25.23 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  37.8 
 
 		 517 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  23.65 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  24.62 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  25.6 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  24.76 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  32.56 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  29.35 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  26.7 
 
 		 263 aa  61.2  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  26.34 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  25.13 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  25.12 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  26.57 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  28.5 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  25.85 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  24.76 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  23.04 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  25.59 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  23.85 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  25.62 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  25.96 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  22.73 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  25.46 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  23.65 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  25.4 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  25.53 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  25.53 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  25.53 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1719  signal peptidase I  27.98 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  26.47 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  23.65 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  24.64 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  36.14 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  27.18 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  25.94 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  23.78 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  24.64 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  27.23 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  24.64 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  23.9 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  24.64 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  30.49 
 
 		 517 aa  57  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  25.21 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  24.17 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  29.82 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  25.63 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  25.82 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  25.71 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  26.98 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  23.31 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  23.67 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  23.31 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  23.31 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  23.31 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  23.31 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  27.2 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  27.45 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  23.31 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  23.31 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  25.96 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>