274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0325 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  100 
 
 		 901 aa  1800    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  40.79 
 
 		 881 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  27.81 
 
 		 956 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  25.33 
 
 		 918 aa  252  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1021 aa  234  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.36 
 
 		 976 aa  222  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.4 
 
 		 970 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  28.82 
 
 		 1078 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  27.96 
 
 		 1077 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  29.79 
 
 		 1206 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  26.11 
 
 		 970 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  23.46 
 
 		 982 aa  88.2  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  26.01 
 
 		 947 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0824  hypothetical protein  23.04 
 
 		 814 aa  84.3  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.8 
 
 		 1028 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  28.45 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1234  trep  21.36 
 
 		 924 aa  72  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  27.05 
 
 		 347 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  24.79 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.72 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  27.72 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  23.31 
 
 		 977 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.42 
 
 		 428 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.83 
 
 		 660 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  27.65 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.11 
 
 		 1078 aa  65.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1447  WD40 domain protein beta Propeller  27.56 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000967065  normal  0.55523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  27.71 
 
 		 1059 aa  65.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1733  hypothetical protein  28.4 
 
 		 836 aa  65.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  35.29 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  26.05 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  25.96 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  25.96 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  27.91 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1792  hypothetical protein  28 
 
 		 836 aa  64.3  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.201909  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  27.96 
 
 		 436 aa  63.9  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.26 
 
 		 442 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  27.44 
 
 		 438 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  26.51 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  25.28 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  25.13 
 
 		 567 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  26.81 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  31.34 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  27.52 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0538  hypothetical protein  28.44 
 
 		 885 aa  62.4  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000796497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  27.32 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  27.17 
 
 		 440 aa  62  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  27.09 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  27.19 
 
 		 430 aa  62  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  28.64 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  26.73 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0858  WD40 domain protein beta Propeller  25.74 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000315652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.04 
 
 		 450 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  26.18 
 
 		 431 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.27 
 
 		 446 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  25.25 
 
 		 1079 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  32.64 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  26.98 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  28.25 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.19 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  28.99 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.19 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  25.88 
 
 		 1062 aa  58.2  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  28.25 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.88 
 
 		 1062 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  26.18 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  25.67 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  27.44 
 
 		 450 aa  57.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  26.18 
 
 		 431 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6241  hypothetical protein  20.24 
 
 		 919 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25.88 
 
 		 1062 aa  57.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  28.25 
 
 		 442 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.88 
 
 		 1062 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  28.25 
 
 		 442 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.63 
 
 		 572 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  25.88 
 
 		 1062 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  29.66 
 
 		 440 aa  56.2  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  28.26 
 
 		 419 aa  57  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  31.03 
 
 		 427 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.39 
 
 		 432 aa  56.6  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.88 
 
 		 1062 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  27.09 
 
 		 428 aa  56.6  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  28.25 
 
 		 442 aa  57  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  27.13 
 
 		 648 aa  55.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  25.75 
 
 		 431 aa  56.2  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  32.56 
 
 		 441 aa  56.2  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  29.66 
 
 		 437 aa  56.2  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.88 
 
 		 1062 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  28.35 
 
 		 450 aa  56.2  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  25.32 
 
 		 431 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>