15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1792 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1733  hypothetical protein  90.91 
 
 		 836 aa  1543    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0538  hypothetical protein  42.6 
 
 		 885 aa  665    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000796497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 836 aa  1692    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.201909  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0894  hypothetical protein  33.77 
 
 		 821 aa  260  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0819646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  22.38 
 
 		 918 aa  65.1  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  28 
 
 		 901 aa  64.3  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1988  hypothetical protein  27.31 
 
 		 923 aa  59.7  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.36521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  28.89 
 
 		 1206 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  23.2 
 
 		 1077 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  24.26 
 
 		 1078 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  23.91 
 
 		 977 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1234  trep  22.98 
 
 		 924 aa  45.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1021 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1427  hypothetical protein  27.19 
 
 		 936 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  25.82 
 
 		 947 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>