21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1427 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1427  hypothetical protein  100 
 
 		 936 aa  1939    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6241  hypothetical protein  30.91 
 
 		 919 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  28.27 
 
 		 977 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0028  hypothetical protein  27.84 
 
 		 914 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.26 
 
 		 976 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  21.24 
 
 		 970 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  21.25 
 
 		 970 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  19.79 
 
 		 956 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  22.11 
 
 		 1021 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  20.68 
 
 		 918 aa  61.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  21.47 
 
 		 1078 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 434 aa  50.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  21.69 
 
 		 947 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  18.94 
 
 		 901 aa  49.3  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  23.38 
 
 		 451 aa  48.1  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  21.1 
 
 		 1077 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  21.76 
 
 		 1028 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1792  hypothetical protein  27.19 
 
 		 836 aa  45.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.201909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  25 
 
 		 441 aa  45.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.75 
 
 		 717 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  27.27 
 
 		 438 aa  44.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>