99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1777 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  74.41 
 
 		 543 aa  805    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  97.81 
 
 		 548 aa  1099    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 548 aa  1115    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  97.81 
 
 		 548 aa  1097    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  79.56 
 
 		 548 aa  906    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  72.39 
 
 		 543 aa  801    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  51.01 
 
 		 542 aa  528  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  46.37 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.88 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.26 
 
 		 562 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.26 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  44.42 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.95 
 
 		 561 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.51 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.45 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.58 
 
 		 561 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.96 
 
 		 558 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  43.48 
 
 		 549 aa  415  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.93 
 
 		 552 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  37.68 
 
 		 566 aa  322  8e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.74 
 
 		 567 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  36.74 
 
 		 567 aa  312  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.56 
 
 		 567 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  35.12 
 
 		 566 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  36.2 
 
 		 567 aa  302  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  34.35 
 
 		 570 aa  297  4e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.28 
 
 		 570 aa  296  5e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.81 
 
 		 569 aa  293  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  35.22 
 
 		 568 aa  293  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  35.2 
 
 		 578 aa  289  7e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.75 
 
 		 570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  32.98 
 
 		 583 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  34.29 
 
 		 568 aa  280  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.98 
 
 		 583 aa  279  7e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 565 aa  277  5e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.44 
 
 		 583 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  30.69 
 
 		 583 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  35.6 
 
 		 566 aa  265  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.58 
 
 		 584 aa  256  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  31.28 
 
 		 597 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.14 
 
 		 584 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.22 
 
 		 566 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  37.63 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  43.75 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  43.33 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  47.54 
 
 		 485 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  40.62 
 
 		 423 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  40.21 
 
 		 485 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  36.36 
 
 		 428 aa  52  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  40 
 
 		 446 aa  51.2  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  42.19 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  45.9 
 
 		 485 aa  50.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  43.75 
 
 		 441 aa  50.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  39.06 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  39.06 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  43.33 
 
 		 427 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  47.46 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.07 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  37.78 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  37.78 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  40.62 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  39.06 
 
 		 448 aa  47.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  41.54 
 
 		 427 aa  47.4  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  40.62 
 
 		 425 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  40.62 
 
 		 425 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  43.33 
 
 		 423 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  43.33 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  39.06 
 
 		 439 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  41.67 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  40.32 
 
 		 530 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.68 
 
 		 429 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  34.29 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  48.15 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  39.06 
 
 		 424 aa  45.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 		 423 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  40.98 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40 
 
 		 436 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  35.94 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  39.06 
 
 		 426 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  32.35 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  34.38 
 
 		 425 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  35.94 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.08 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.87 
 
 		 428 aa  44.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  43.86 
 
 		 481 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.51 
 
 		 432 aa  44.3  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  39.29 
 
 		 436 aa  44.3  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  38.33 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  34.38 
 
 		 425 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  38.6 
 
 		 497 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  41.38 
 
 		 430 aa  43.9  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  36.51 
 
 		 431 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  38.98 
 
 		 422 aa  43.5  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  45 
 
 		 433 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  38.24 
 
 		 586 aa  43.5  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  40.98 
 
 		 484 aa  43.5  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>