More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0990 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0990  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 146 aa  296  6e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.140527 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0124  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.03 
 
 		 1694 aa  63.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 1094 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 927 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  35.96 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 602 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  36.84 
 
 		 576 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 543 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 4079 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 388 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 596 aa  57  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  45 
 
 		 560 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 754 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 754 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 591 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 		 836 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  42.19 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1085 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 824 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  32.99 
 
 		 682 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 565 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  32.61 
 
 		 564 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0739  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.725007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 3560 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  36.71 
 
 		 1979 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 589 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 562 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 		 632 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 1049 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.54 
 
 		 738 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.2 
 
 		 810 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.33 
 
 		 439 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 213 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1127 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 		 1737 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 465 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  41.67 
 
 		 573 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  34.15 
 
 		 887 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 250 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 243 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 512 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.98 
 
 		 784 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 317 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 4489 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 565 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 1276 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.1 
 
 		 439 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 878 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  36.67 
 
 		 385 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1138 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 395 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  37 
 
 		 340 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  40 
 
 		 407 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 892 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.52 
 
 		 707 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 573 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 621 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.26 
 
 		 623 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 234 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  32 
 
 		 750 aa  48.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  45.16 
 
 		 398 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 1827 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 162 aa  47.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 251 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 594 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.7 
 
 		 1056 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 465 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  46.55 
 
 		 644 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.62 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1281  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 816 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  35.06 
 
 		 539 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1069 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  43.33 
 
 		 293 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.78 
 
 		 397 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 3035 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 711 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.55 
 
 		 364 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 273 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.91 
 
 		 703 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 1297 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.46 
 
 		 784 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.46 
 
 		 818 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 274 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 713 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 1161 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 448 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 486 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.14 
 
 		 1034 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>