More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3294 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  81.9 
 
 		 463 aa  725    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  87.93 
 
 		 472 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  100 
 
 		 469 aa  909    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  36.73 
 
 		 473 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  34.42 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  34.36 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  36.96 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  34.36 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  34.51 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  35.84 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  28.71 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  29.74 
 
 		 474 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  27.56 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  30.13 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.13 
 
 		 483 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  27.11 
 
 		 463 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  27.11 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 466 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.32 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.12 
 
 		 483 aa  94  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  28.22 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  28.94 
 
 		 463 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  26.48 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.92 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.47 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.91 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.62 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  23.98 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.9 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.72 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.85 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.02 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  24.11 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.05 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.27 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  27.56 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.43 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  23.12 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  24.15 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  23.64 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  23.64 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.18 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  27.72 
 
 		 543 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  23.38 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  23.38 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.38 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.38 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.12 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  23.38 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  23.38 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  27.37 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  27.37 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  21.14 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  22.76 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.58 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.76 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.5 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  21.61 
 
 		 537 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  23.59 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  22.31 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  24.93 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  23.73 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  27.85 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.06 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  23.82 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  21.06 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  24.42 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.27 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  25.95 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.78 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2834  Na+/solute symporter  24.43 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00723472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  23.02 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  22.61 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  24.05 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  22.31 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.01 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1898  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.29 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  22.17 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  20.76 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  22.61 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.58 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  22.61 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  25.52 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.86 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0986  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.74 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>