More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0293 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 291 aa  557  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2314  citrate (pro-3S)-lyase  88.24 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  60.84 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  55.28 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  53.87 
 
 		 282 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  52.08 
 
 		 292 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  54.9 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  51.2 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  51.03 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  53.95 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  52.78 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  47.93 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  48.94 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  51.23 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  47.57 
 
 		 278 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  44.52 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  51.23 
 
 		 279 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758  putative citrate lyase beta chain (acyl lyase subunit)  48.79 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.5 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1255  Citrate (pro-3S)-lyase  43.66 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.0181011 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  39.16 
 
 		 292 aa  162  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  39.16 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  38.95 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  43.21 
 
 		 276 aa  159  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  35.31 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  39.58 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  37.89 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  37.89 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  42.36 
 
 		 277 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  36.24 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  38.13 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  38.62 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  39.93 
 
 		 406 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  37.11 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.11 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  36.55 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  36.73 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  36.73 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  36.84 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  37.84 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.77 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  32.17 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  37.63 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  36.71 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.2 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.2 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.2 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  32.39 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  38.6 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.86 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  37.2 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  36.12 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  36.18 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.57 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  37.2 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  38.62 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  34.74 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  37.72 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  37.41 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  36.36 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  33.22 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  39.45 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  36.39 
 
 		 274 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  37.06 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  36.39 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  34.47 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  35.4 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  37.93 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  39.19 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  36.86 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  35.89 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  38.11 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  40.64 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.25 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  38.25 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  34.03 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  32.75 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  35.29 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  36.18 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  37.37 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  37.1 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  34.13 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  36.71 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  34.49 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  37.63 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  35.19 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.78 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  38.81 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  36.71 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  36.79 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  38.78 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  38.78 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  38.78 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.78 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.78 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  38.78 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.01 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  35.05 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>