More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0630 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  100 
 
 		 347 aa  712    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  41.18 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  37.5 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  37.58 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  39.35 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  38.1 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  37.91 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  37.58 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  40.07 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  38.8 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  36.27 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  34.2 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  36.25 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  35 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  34.97 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  32.12 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  31.29 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  26 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  25.58 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  24.91 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  20.76 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  22.73 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  23.66 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  21.23 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  24.14 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  24 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  22.65 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.4 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  24.57 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  24.82 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  26.96 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  26.38 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  21.6 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  20.55 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  29.76 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  23.01 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  22.71 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.22 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  24.22 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.88 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.48 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  23.77 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  21.93 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  22.6 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  22.34 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.46 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  27.07 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  24.08 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  23.77 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  21.6 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  26.9 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  20.54 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  27.65 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  23.33 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  22.65 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.01 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  21.59 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  21.2 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.4 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  21.18 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  26.35 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  20.38 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  24.9 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  24.87 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  23.9 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  21.55 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1434  integrase family protein  23.2 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  26.29 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  21.89 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  21.97 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.46 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  23.33 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  23.63 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  24.07 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  20.41 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  27.27 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  29.94 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.02 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  21.7 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  21.2 
 
 		 313 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.12 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>