72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1538 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1211    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  45.51 
 
 		 610 aa  548  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  45.44 
 
 		 625 aa  535  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  29.64 
 
 		 647 aa  263  6e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 652 aa  243  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  27.08 
 
 		 660 aa  232  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 716 aa  230  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 644 aa  230  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  26.41 
 
 		 641 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  26.99 
 
 		 625 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 807 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  25.86 
 
 		 684 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  24.36 
 
 		 802 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  25.96 
 
 		 715 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  23.53 
 
 		 536 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  23.6 
 
 		 678 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  23.36 
 
 		 697 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 680 aa  140  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  22.07 
 
 		 679 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  30.96 
 
 		 332 aa  124  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 306 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  26.56 
 
 		 349 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 296 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  30.17 
 
 		 329 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 307 aa  109  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  27.35 
 
 		 349 aa  103  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  31.31 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 328 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 284 aa  90.9  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  27.21 
 
 		 290 aa  73.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  21.82 
 
 		 658 aa  68.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  24.28 
 
 		 581 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  20.6 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  23.48 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  24.78 
 
 		 574 aa  57  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  20.63 
 
 		 604 aa  57  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  28.98 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 325 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  20.15 
 
 		 582 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  27.14 
 
 		 554 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 295 aa  55.1  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  22.7 
 
 		 273 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25 
 
 		 317 aa  53.5  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  28.46 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  24.34 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  21.51 
 
 		 578 aa  51.6  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 325 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  25.2 
 
 		 325 aa  50.4  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  22.83 
 
 		 325 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 325 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  32.1 
 
 		 325 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 325 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 325 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  21.93 
 
 		 322 aa  49.7  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  27.1 
 
 		 325 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 330 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  28.17 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 323 aa  47.8  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 325 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  26.55 
 
 		 293 aa  47.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  34.48 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  23.01 
 
 		 307 aa  45.8  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 325 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  24.18 
 
 		 261 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 325 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 279 aa  44.3  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 310 aa  43.9  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  21.13 
 
 		 558 aa  43.9  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  30.97 
 
 		 287 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>