234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1740 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  100 
 
 
277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  42.7 
 
 
275 aa  240  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  34.91 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  34.91 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  33.33 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  34.19 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  33.33 
 
 
272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  33.58 
 
 
273 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  33.94 
 
 
273 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  32.35 
 
 
272 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  34.44 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  35.29 
 
 
274 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  32.97 
 
 
275 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  33.7 
 
 
262 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  33.46 
 
 
274 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  31.88 
 
 
263 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  30.37 
 
 
275 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  31 
 
 
274 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  30.91 
 
 
274 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  30.36 
 
 
278 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  30.74 
 
 
274 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  31.25 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  30.11 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  30.11 
 
 
277 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  33.21 
 
 
271 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  30.35 
 
 
273 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  30.55 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  29.09 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  28.1 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  28.63 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  27.72 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  27.78 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  27.6 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  24.73 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.98 
 
 
278 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  24.91 
 
 
287 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25.09 
 
 
272 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  26.49 
 
 
295 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  25.63 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  24.4 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  23.64 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.5 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.4 
 
 
188 aa  72  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.39 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.72 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.27 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.33 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.97 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.42 
 
 
278 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  23.27 
 
 
191 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  23.99 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.4 
 
 
204 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  26.11 
 
 
189 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  25.84 
 
 
196 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.53 
 
 
191 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.7 
 
 
184 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.53 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.75 
 
 
170 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.02 
 
 
168 aa  56.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  24.14 
 
 
187 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.29 
 
 
163 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.13 
 
 
178 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.33 
 
 
163 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  23.53 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2895  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  36.71 
 
 
754 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  25.43 
 
 
170 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  22.63 
 
 
186 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  25.63 
 
 
176 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2126  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  36.84 
 
 
756 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25 
 
 
190 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  24.24 
 
 
166 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1964  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  35 
 
 
766 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030199 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  22.63 
 
 
173 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  24.49 
 
 
184 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  23.76 
 
 
188 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  22.91 
 
 
172 aa  52.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  25.84 
 
 
183 aa  52.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  24.24 
 
 
166 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  24.26 
 
 
252 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  24.87 
 
 
202 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  24.17 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  22.68 
 
 
194 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.29 
 
 
176 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  25.39 
 
 
192 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  26.13 
 
 
172 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  22.65 
 
 
192 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  25.14 
 
 
175 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  19.79 
 
 
176 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.84 
 
 
1481 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.12 
 
 
183 aa  49.7  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.06 
 
 
298 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0370155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1112  heterodisulfide reductase, iron-sulfur-binding subunit, putative  32.89 
 
 
756 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0184173  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  23.12 
 
 
171 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2134  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  32.91 
 
 
758 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.696722  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  33.33 
 
 
810 aa  48.9  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  25.89 
 
 
172 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.35 
 
 
418 aa  48.9  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  22.56 
 
 
201 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  35.48 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  36 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>