More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2281 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2281  ribonuclease II  100 
 
 		 489 aa  983    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1199  ribonuclease II  66.12 
 
 		 518 aa  642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.548982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1145  ribonuclease II  62.73 
 
 		 492 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0817  ribonuclease II  60 
 
 		 497 aa  586  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1422  exoribonuclease II  49.27 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2925  exoribonuclease II  47.96 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4011  exoribonuclease II  47.45 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  31 
 
 		 710 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  30.8 
 
 		 710 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  31.49 
 
 		 726 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  31.26 
 
 		 726 aa  189  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  31.52 
 
 		 910 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  33.27 
 
 		 858 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  30.36 
 
 		 817 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  33.2 
 
 		 857 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  31.62 
 
 		 808 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  31.62 
 
 		 808 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  32.2 
 
 		 829 aa  183  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  31.93 
 
 		 807 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  31.93 
 
 		 807 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  31.93 
 
 		 807 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  31.07 
 
 		 808 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  31.7 
 
 		 809 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  30.65 
 
 		 805 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  30.02 
 
 		 813 aa  181  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  31.62 
 
 		 801 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  31.7 
 
 		 807 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  30.06 
 
 		 937 aa  179  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  31.87 
 
 		 706 aa  179  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  31.7 
 
 		 807 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  31.98 
 
 		 715 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  29.5 
 
 		 770 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  32.86 
 
 		 857 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  29.5 
 
 		 771 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  29.81 
 
 		 770 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  29.28 
 
 		 752 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  28.81 
 
 		 708 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  30.39 
 
 		 819 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  29.74 
 
 		 737 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  30.77 
 
 		 826 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  30.92 
 
 		 833 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  28.86 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  29.18 
 
 		 863 aa  171  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  30.32 
 
 		 758 aa  170  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  27.05 
 
 		 1182 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  29.35 
 
 		 766 aa  170  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  29.93 
 
 		 824 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  29.14 
 
 		 828 aa  170  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  29.04 
 
 		 758 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.58 
 
 		 735 aa  170  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  27.96 
 
 		 763 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  26.41 
 
 		 704 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  28.82 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  27.33 
 
 		 716 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  28.92 
 
 		 876 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  29.58 
 
 		 813 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  27.57 
 
 		 810 aa  168  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  29.61 
 
 		 817 aa  168  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  30.84 
 
 		 808 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  29.58 
 
 		 813 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.58 
 
 		 813 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  25.31 
 
 		 718 aa  167  4e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6672  ribonuclease R  31.35 
 
 		 762 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.594925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  29.58 
 
 		 813 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  31.36 
 
 		 842 aa  167  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  29.58 
 
 		 813 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  29.58 
 
 		 813 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  28.77 
 
 		 830 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  28.12 
 
 		 737 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  29.58 
 
 		 813 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  29.58 
 
 		 813 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  30.49 
 
 		 706 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3034  ribonuclease R  30.46 
 
 		 781 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0258557  normal  0.241672 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  29.44 
 
 		 812 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  28 
 
 		 762 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  28.07 
 
 		 737 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  29.44 
 
 		 812 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2438  ribonuclease R  31.56 
 
 		 790 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  29.55 
 
 		 794 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2418  exoribonuclease R  30.46 
 
 		 783 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0155442  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  26.98 
 
 		 792 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  28.49 
 
 		 790 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3160  ribonuclease R  29.91 
 
 		 701 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  29.44 
 
 		 812 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  28.49 
 
 		 790 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  29.44 
 
 		 812 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  29.44 
 
 		 812 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  28.54 
 
 		 726 aa  164  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  29.18 
 
 		 813 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  28.68 
 
 		 877 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  29.61 
 
 		 777 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  29.28 
 
 		 810 aa  163  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  30.79 
 
 		 722 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  27.22 
 
 		 759 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  29.45 
 
 		 818 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  30.35 
 
 		 819 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  30.62 
 
 		 818 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  28.37 
 
 		 804 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  30.54 
 
 		 754 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  28.75 
 
 		 880 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>