More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0817 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0817  ribonuclease II  100 
 
 		 497 aa  1020    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1199  ribonuclease II  61.52 
 
 		 518 aa  615  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.548982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2281  ribonuclease II  60 
 
 		 489 aa  586  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1145  ribonuclease II  56.91 
 
 		 492 aa  553  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1422  exoribonuclease II  47.34 
 
 		 492 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2925  exoribonuclease II  44.06 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4011  exoribonuclease II  43.97 
 
 		 490 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  28.71 
 
 		 694 aa  189  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  31.67 
 
 		 857 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  30.74 
 
 		 858 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  29.26 
 
 		 771 aa  180  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  31.34 
 
 		 857 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  28.82 
 
 		 770 aa  177  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  28.24 
 
 		 810 aa  177  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  31.75 
 
 		 910 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  28.79 
 
 		 770 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  28.09 
 
 		 726 aa  171  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  30.69 
 
 		 722 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  29.22 
 
 		 819 aa  170  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  27.7 
 
 		 726 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  28.04 
 
 		 812 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  28.24 
 
 		 813 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  28.04 
 
 		 812 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  27.72 
 
 		 710 aa  166  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  28.24 
 
 		 813 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.24 
 
 		 813 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3160  ribonuclease R  32.04 
 
 		 701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  28.24 
 
 		 813 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  27.53 
 
 		 710 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  28.24 
 
 		 813 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  28.24 
 
 		 813 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  28.24 
 
 		 813 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  28.24 
 
 		 813 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.64 
 
 		 735 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  27.84 
 
 		 812 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  27.84 
 
 		 812 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  27.84 
 
 		 812 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  28.04 
 
 		 813 aa  163  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2449  ribonuclease R  29.12 
 
 		 808 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.162395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  29.5 
 
 		 808 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  29.5 
 
 		 808 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  27.75 
 
 		 805 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  27.68 
 
 		 818 aa  160  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  26.15 
 
 		 801 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  29.02 
 
 		 808 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  28.95 
 
 		 766 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  26.61 
 
 		 817 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2988  ribonuclease R  27.66 
 
 		 771 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  28.67 
 
 		 818 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  29.36 
 
 		 817 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  28.38 
 
 		 715 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  27.92 
 
 		 737 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  28.73 
 
 		 733 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  32.58 
 
 		 535 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  27.98 
 
 		 746 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  29.26 
 
 		 809 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  27.98 
 
 		 746 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  27.87 
 
 		 829 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  27.58 
 
 		 830 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  30.41 
 
 		 813 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  25.93 
 
 		 667 aa  157  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  28.8 
 
 		 842 aa  156  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  28.6 
 
 		 822 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  28.41 
 
 		 763 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  29.29 
 
 		 833 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  27.86 
 
 		 758 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0737  ribonuclease R  32.01 
 
 		 852 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  26.05 
 
 		 833 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  25.79 
 
 		 704 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  27.16 
 
 		 815 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3791  exoribonuclease R  28.76 
 
 		 844 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  27.2 
 
 		 720 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0692  exoribonuclease R  28.76 
 
 		 844 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  27.02 
 
 		 824 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  27.21 
 
 		 726 aa  154  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3646  exoribonuclease R  28.76 
 
 		 844 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  29.98 
 
 		 840 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  27.75 
 
 		 826 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  27.86 
 
 		 759 aa  154  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0576  ribonuclease R  26.27 
 
 		 749 aa  153  5e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  28.28 
 
 		 937 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  29.32 
 
 		 754 aa  153  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  29.73 
 
 		 1182 aa  153  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1755  ribonuclease R  27.29 
 
 		 792 aa  153  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  30.11 
 
 		 863 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  27.13 
 
 		 755 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  27.9 
 
 		 838 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  27.92 
 
 		 821 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  27.12 
 
 		 758 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  28 
 
 		 818 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  28.4 
 
 		 861 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  28.48 
 
 		 795 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  28.78 
 
 		 807 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  28.42 
 
 		 805 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  29.19 
 
 		 808 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  25.43 
 
 		 708 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  29.37 
 
 		 807 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  29.37 
 
 		 807 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  29.05 
 
 		 824 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  28.78 
 
 		 807 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>