261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1800 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  50.7 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  43.9 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  43.96 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  41.98 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  38.31 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  41.95 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  40.41 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  41.46 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  38.54 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  43 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  41.41 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  40.29 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  39.8 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  38.94 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.89 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  37.96 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  37.85 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  41 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  39 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  34.58 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  40.1 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  36.54 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  33.64 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  40.31 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  37.07 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  38.61 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  36 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  38.12 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  37.13 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  35.75 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  37.68 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  37.02 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  31.53 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  38.46 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  38.46 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  36.84 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.83 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.55 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  37.43 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  36.26 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  35.64 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.84 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  32.49 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  31.34 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  34.9 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  35.09 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  35.57 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  36.02 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  35.57 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  34.4 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  36.81 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  40.82 
 
 		 297 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  35.11 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  34.55 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  33.16 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  39.55 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  32.77 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  31.72 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  41.09 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  38.57 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.09 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  32.8 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  31.64 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  32.42 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  31.07 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  29.73 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  42.45 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  37.86 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  26.56 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.76 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  27.32 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.65 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  25.82 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.81 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.47 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  26.4 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  22.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  27.36 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  25.14 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.42 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.28 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.24 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  27.47 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  28.42 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.43 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  25.63 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  25.63 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  26.67 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  27.8 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  24.87 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.13 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  24.02 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  24.04 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.74 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  26.34 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1026  EndoIII-related endonuclease  28.36 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.744613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.3 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  21.6 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  23.66 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>