More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2113 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2113  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 360 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2743  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.24 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  30.09 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0216385  normal  0.245234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  28.24 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  30.49 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2051  RND family efflux transporter MFP subunit  31.38 
 
 		 364 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0552963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0868  RND family efflux transporter MFP subunit  30.12 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0171  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 387 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4621  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 		 386 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  30.34 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2624  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  25.35 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2570  hypothetical protein  25.86 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295981  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1163  efflux transporter  32.93 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.707562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  23.68 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0510  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0586812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0988  secretion protein HlyD  29.58 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.15 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  30.59 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.55 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2197  secretion protein HlyD  32.04 
 
 		 446 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.378347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  27.86 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  30.34 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  30.09 
 
 		 472 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  30.09 
 
 		 478 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  30.09 
 
 		 478 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.73 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  29.47 
 
 		 455 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 455 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  28 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  26.17 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  27.88 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  28.12 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  27.84 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  28.72 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  27.84 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  24.85 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.84 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  21.9 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.1 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  27.33 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  28.53 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 		 1462 aa  80.1  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  26.06 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  28.83 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  27.82 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  29.73 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.57 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  29.72 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.79 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  27.61 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  29.94 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  30.03 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  26.6 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  26.52 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  31.71 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  29.61 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.51 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  27.48 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  25.98 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>