More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1186 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 320 aa  644    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  71.29 
 
 		 317 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  71.29 
 
 		 317 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  70.03 
 
 		 317 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  70.35 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  41.2 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  39.02 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  39.07 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  39.67 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  38.13 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  37.27 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  35.45 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  42.29 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  35.31 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  37.55 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  34.78 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  38.04 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  34.11 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  37.96 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.5 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  41.04 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  36.09 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.02 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.43 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.29 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  35.01 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.74 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  35.1 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  35.46 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  42.58 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.68 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  38.56 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  37.13 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  41.3 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  41.33 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  40.38 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  34.5 
 
 		 350 aa  158  9e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  39.27 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  40.87 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  41.05 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  34.32 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.71 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  37.06 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  36.96 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  37.99 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  38.46 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  40.83 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  42.15 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  41.03 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  40.6 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  41.41 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  37.73 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  30.99 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  34.1 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  38.24 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  36.09 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  41.1 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  37.25 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  36.32 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.99 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  32.11 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  34.41 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  40.25 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  35.62 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  34.4 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  37.05 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  32.55 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  37.05 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  37.05 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  31.6 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  32.01 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  31.11 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  34.44 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  41.3 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  38.82 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  30.74 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  30.2 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  30.82 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  35.22 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  32.88 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  34.52 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  39.06 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  36.9 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  32.68 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>