More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00593 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 356 aa  711    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  44.72 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  47.32 
 
 		 345 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  35.9 
 
 		 395 aa  209  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 571 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 550 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 230 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 563 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 563 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 524 aa  89.4  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 579 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 557 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 581 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  30.81 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 559 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 545 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 600 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 593 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 542 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 545 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 545 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  25.24 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 563 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 563 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  28.44 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  25.95 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  25.77 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  25.22 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  26.09 
 
 		 807 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  26.55 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  26.51 
 
 		 806 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  25.64 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  26.5 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  23.81 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  25.7 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  24.04 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  23.13 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  28.46 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 288 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  21.76 
 
 		 570 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  26 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  23.94 
 
 		 538 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 830 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  26.88 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 779 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  27.51 
 
 		 531 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  24.81 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 273 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  34.44 
 
 		 563 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 847 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  23.41 
 
 		 803 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  21.37 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 549 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 549 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  30.17 
 
 		 532 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.94 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 549 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  23.83 
 
 		 799 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 550 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  23.41 
 
 		 803 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  20.72 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  21.48 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 840 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 551 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.63 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 860 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 551 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  22.12 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 547 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 300 aa  53.9  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  28.31 
 
 		 847 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 276 aa  53.5  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  21.38 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 286 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  28.96 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  22.67 
 
 		 803 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  25.33 
 
 		 366 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>