More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3007 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 363 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  71.01 
 
 		 341 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  69.86 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  50.28 
 
 		 615 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  47.49 
 
 		 526 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.83 
 
 		 980 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  53.14 
 
 		 460 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.64 
 
 		 2668 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  60.85 
 
 		 686 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.76 
 
 		 2105 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  52.2 
 
 		 460 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 1795 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  66.67 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  66.67 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  59.39 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.33 
 
 		 1016 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  48.65 
 
 		 946 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  41.76 
 
 		 2667 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.38 
 
 		 1279 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.41 
 
 		 1363 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  43.75 
 
 		 595 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.05 
 
 		 1236 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  44.79 
 
 		 1534 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.57 
 
 		 613 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1424 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  43.62 
 
 		 2954 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  42.55 
 
 		 1400 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  42.95 
 
 		 1164 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  37.28 
 
 		 2775 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  40.77 
 
 		 1895 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.24 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.88 
 
 		 1532 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.54 
 
 		 1287 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.8 
 
 		 3954 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  47.74 
 
 		 4334 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  40.82 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  37.4 
 
 		 1499 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  42.92 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.27 
 
 		 556 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.03 
 
 		 1712 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.47 
 
 		 3619 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  38.11 
 
 		 1156 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.18 
 
 		 9867 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  32.51 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.86 
 
 		 3619 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  42.2 
 
 		 833 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.12 
 
 		 1079 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.59 
 
 		 2678 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  37.33 
 
 		 1855 aa  139  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  40.38 
 
 		 2885 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  37.39 
 
 		 437 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  40.98 
 
 		 965 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  43.14 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  43.14 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.53 
 
 		 3427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  40.15 
 
 		 982 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  36.26 
 
 		 3608 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  40.28 
 
 		 2145 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  39.18 
 
 		 850 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  35.54 
 
 		 2689 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  34.81 
 
 		 437 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  40.77 
 
 		 589 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  46.74 
 
 		 1043 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  36.5 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  41.13 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  37.12 
 
 		 4687 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.02 
 
 		 588 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  40.69 
 
 		 219 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  33.86 
 
 		 1544 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  34.06 
 
 		 795 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  38.59 
 
 		 4800 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.25 
 
 		 2911 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  34.37 
 
 		 1383 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.19 
 
 		 855 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  35.85 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 907 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  39.45 
 
 		 5171 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  40.39 
 
 		 561 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.6 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  42.11 
 
 		 950 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  35.58 
 
 		 3209 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.22 
 
 		 1197 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  36.21 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  37.93 
 
 		 757 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  35.46 
 
 		 475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0017  hemolysin-type calcium-binding region  35.57 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  35.42 
 
 		 769 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  36.57 
 
 		 824 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  40.85 
 
 		 938 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  34.11 
 
 		 245 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  30.59 
 
 		 745 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  40.2 
 
 		 1884 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  31.24 
 
 		 860 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  37.97 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  34.38 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.58 
 
 		 820 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  38.43 
 
 		 257 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>