83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0812 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  100 
 
 		 385 aa  776    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  75.44 
 
 		 344 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  65.19 
 
 		 346 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  41.96 
 
 		 370 aa  239  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  41.96 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  40.64 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  38.44 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  44.12 
 
 		 250 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  39.7 
 
 		 359 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  34.87 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  33.93 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  33.69 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  28.61 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  34.64 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  34.43 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  39.15 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  28.66 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  40.1 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  28.36 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  30.95 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  32.99 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  32.86 
 
 		 296 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  35.51 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  32.16 
 
 		 373 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  29.2 
 
 		 335 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  32.47 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  27.81 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  30.2 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  29.64 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  29.25 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  28.92 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  30.59 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.98 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.32 
 
 		 311 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  28.46 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  26.74 
 
 		 344 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  24.61 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  27.92 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0910  putative integrase  41.3 
 
 		 95 aa  63.9  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.690439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  27.41 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  28.96 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  24.8 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  28.84 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  28.11 
 
 		 538 aa  49.7  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  22.67 
 
 		 342 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  27.4 
 
 		 283 aa  49.7  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  24.29 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  27.8 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  23.97 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  31.72 
 
 		 197 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  25.42 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  32.32 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 347 aa  46.2  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  27.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  25.79 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  22.96 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  31.03 
 
 		 164 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  23.62 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  25.99 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  25.99 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  28.5 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  26.46 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  26.46 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  36.14 
 
 		 101 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  24.31 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  25.4 
 
 		 315 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  24.61 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 298 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 298 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  21.28 
 
 		 386 aa  43.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  36.76 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  21.57 
 
 		 301 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.21 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>