123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2497 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  100 
 
 		 739 aa  1519    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  100 
 
 		 703 aa  1443    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  34.62 
 
 		 605 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  31.12 
 
 		 663 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  31.41 
 
 		 648 aa  258  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  31.81 
 
 		 646 aa  258  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  31.41 
 
 		 648 aa  257  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  31.17 
 
 		 648 aa  256  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.169795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  31.2 
 
 		 646 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  31.2 
 
 		 631 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  31.51 
 
 		 635 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  31.35 
 
 		 646 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  31.05 
 
 		 646 aa  251  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 731 aa  203  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  34.91 
 
 		 709 aa  184  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 732 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  30.9 
 
 		 1204 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.81 
 
 		 682 aa  171  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  31.8 
 
 		 762 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 404 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  29.9 
 
 		 1121 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  27.87 
 
 		 523 aa  101  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 400 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  25.73 
 
 		 673 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  27.25 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  27.32 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  48.21 
 
 		 281 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  56.52 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  64.1 
 
 		 310 aa  62  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  47.92 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  51.02 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  60.98 
 
 		 154 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  49.09 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  42.67 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  35.11 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  44.44 
 
 		 269 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  25 
 
 		 452 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  36.71 
 
 		 258 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  35.44 
 
 		 257 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  58.14 
 
 		 251 aa  56.2  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  44.44 
 
 		 259 aa  55.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  51.16 
 
 		 670 aa  55.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  55.88 
 
 		 267 aa  54.7  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  44.23 
 
 		 252 aa  54.7  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  52 
 
 		 671 aa  54.3  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  51.43 
 
 		 338 aa  54.3  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  58.33 
 
 		 254 aa  53.9  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  48.65 
 
 		 329 aa  53.5  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  52.94 
 
 		 262 aa  53.9  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  51.02 
 
 		 272 aa  53.9  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  50 
 
 		 671 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  40.98 
 
 		 670 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 450 aa  52.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  40.98 
 
 		 670 aa  52.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  56.25 
 
 		 260 aa  52  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  50 
 
 		 671 aa  52  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  46.51 
 
 		 666 aa  52  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  54.05 
 
 		 271 aa  51.6  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  53.12 
 
 		 256 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  46.51 
 
 		 670 aa  50.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  46.51 
 
 		 676 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  54.05 
 
 		 744 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  46.51 
 
 		 676 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  52.08 
 
 		 780 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  51.52 
 
 		 267 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7836  hypothetical protein  24.02 
 
 		 500 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  29.29 
 
 		 230 aa  48.9  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  34.38 
 
 		 255 aa  48.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 332 aa  48.1  0.0005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  23.99 
 
 		 475 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  50 
 
 		 348 aa  47.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  32.43 
 
 		 689 aa  47.8  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  44.74 
 
 		 228 aa  47.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  22.22 
 
 		 614 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  24.19 
 
 		 706 aa  47  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  42.11 
 
 		 230 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4508  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  47.37 
 
 		 181 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000112025  hitchhiker  0.000168776 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2246  DNA topoisomerase III  36.67 
 
 		 685 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.205011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2671  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 552 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  26.09 
 
 		 700 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  26.09 
 
 		 700 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  29.41 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  27.35 
 
 		 714 aa  46.2  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 783 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  26.72 
 
 		 689 aa  45.8  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 710 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  50 
 
 		 654 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  47.37 
 
 		 697 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  48.89 
 
 		 758 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  46.15 
 
 		 655 aa  45.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  46.15 
 
 		 730 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  27.33 
 
 		 272 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  46.88 
 
 		 743 aa  45.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  42.11 
 
 		 249 aa  45.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2529  DNA topoisomerase III  40.74 
 
 		 722 aa  45.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  47.83 
 
 		 836 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  50 
 
 		 655 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 		 473 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1641  hypothetical protein  24.22 
 
 		 399 aa  45.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.649993 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>