50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0632 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  59.84 
 
 
499 aa  660    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  61.45 
 
 
499 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  60.36 
 
 
499 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  61.45 
 
 
499 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  100 
 
 
498 aa  1045    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  56.83 
 
 
505 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2989  serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 
472 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  28 
 
 
439 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  30.3 
 
 
431 aa  90.9  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  27.89 
 
 
452 aa  89  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  26.49 
 
 
444 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  29.07 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
447 aa  65.1  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 
762 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  28.02 
 
 
1121 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  23.24 
 
 
1204 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
732 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 
731 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.7 
 
 
682 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  23.75 
 
 
605 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
641 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28923  predicted protein  30.25 
 
 
348 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125872  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  31.73 
 
 
2279 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
1914 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
377 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 
517 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  29.41 
 
 
739 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  26.38 
 
 
709 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  29.41 
 
 
703 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
581 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16067  predicted protein  28.45 
 
 
264 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0854835  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03300  protein kinase C, putative  30.43 
 
 
1086 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.218688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3510  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 
363 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1655  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
260 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0659373  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  27.27 
 
 
2272 aa  44.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_3730  predicted protein  28.57 
 
 
300 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5860  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
482 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.628207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.83 
 
 
2051 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
1192 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  23.5 
 
 
641 aa  43.5  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  23.35 
 
 
663 aa  43.5  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3630  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
594 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  22.91 
 
 
673 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  27.83 
 
 
325 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.48 
 
 
1663 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1875  predicted protein  29.46 
 
 
353 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.6 
 
 
1794 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
603 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07240  CAP64 gene product - related  32.11 
 
 
974 aa  43.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>