More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4257 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  100 
 
 
475 aa  977    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
447 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  27.5 
 
 
499 aa  90.1  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  27.08 
 
 
499 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  28.7 
 
 
505 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  29.58 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  28.94 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2989  serine/threonine protein kinase  25.88 
 
 
472 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  29.41 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 
499 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
731 aa  67.8  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
439 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  27.83 
 
 
452 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  27.16 
 
 
431 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 
783 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  24.87 
 
 
1204 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 
1398 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5794  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
1309 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  24.28 
 
 
739 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  28.64 
 
 
519 aa  56.6  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
1422 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  24.28 
 
 
703 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  23.84 
 
 
1121 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  22.42 
 
 
605 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
695 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  37.37 
 
 
1100 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04130  protein threonine/tyrosine kinase, putative  27.2 
 
 
674 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.624384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
444 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
650 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.56 
 
 
682 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 
601 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 
1400 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.13 
 
 
1072 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.13 
 
 
1076 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.13 
 
 
1072 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
493 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
990 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 
706 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05759  serine/threonine protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06720)  24.18 
 
 
884 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355098  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
653 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
1346 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0168  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00403231  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  21.46 
 
 
322 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2221  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3082  predicted protein  23.66 
 
 
273 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0293264  hitchhiker  0.0000000157294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 
1085 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.69 
 
 
1110 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  30.92 
 
 
329 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.11 
 
 
863 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  23.14 
 
 
641 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4013  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
619 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366631  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  23.21 
 
 
684 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 
503 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2783  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 
472 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0477185  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  23.43 
 
 
700 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.47 
 
 
503 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
985 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.87 
 
 
505 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  21.03 
 
 
663 aa  50.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  24.69 
 
 
996 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  24.49 
 
 
683 aa  50.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
982 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21961  predicted protein  30.48 
 
 
320 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  30.26 
 
 
329 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04110  calmodulin-dependent protein kinase, putative  30.48 
 
 
362 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.9 
 
 
1626 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
982 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3085  predicted protein  28.07 
 
 
267 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230321  normal  0.0682268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5322  serine/threonine protein kinase  22.38 
 
 
671 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_4563  predicted protein  26.09 
 
 
275 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
1320 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.45 
 
 
614 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.46 
 
 
675 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.21 
 
 
585 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 
664 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  22.01 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3630  serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 
594 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.36 
 
 
598 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65458  [Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase(NADPH)] kinase KIN2  27.36 
 
 
1174 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.431881  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2648  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
578 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0958386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0999  serine/threonine kinase protein  26.67 
 
 
896 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.24 
 
 
1044 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  22.64 
 
 
343 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  22.01 
 
 
340 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  21.64 
 
 
292 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.92 
 
 
1856 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
618 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  25.81 
 
 
593 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  28.18 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  30.92 
 
 
331 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0797  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
663 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.921137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  23.66 
 
 
973 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2378  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
661 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.4 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34071  predicted protein  23.79 
 
 
355 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34210  predicted protein  27.5 
 
 
385 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.100013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1605  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 
276 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.3354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>