45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2877 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  100 
 
 		 703 aa  1445    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  100 
 
 		 739 aa  1443    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  34.62 
 
 		 605 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  31.27 
 
 		 663 aa  271  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  31.41 
 
 		 648 aa  258  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  31.41 
 
 		 648 aa  258  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  31.81 
 
 		 646 aa  257  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  31.2 
 
 		 646 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  31.17 
 
 		 648 aa  256  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  31.2 
 
 		 631 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  31.51 
 
 		 635 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  31.35 
 
 		 646 aa  253  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  31.05 
 
 		 646 aa  251  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 731 aa  204  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  34.91 
 
 		 709 aa  184  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 732 aa  184  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  30.9 
 
 		 1204 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.81 
 
 		 682 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  31.8 
 
 		 762 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  29.9 
 
 		 1121 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  27.87 
 
 		 523 aa  101  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 400 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  25.73 
 
 		 673 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  27.25 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  27.32 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  25 
 
 		 452 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 450 aa  52.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7836  hypothetical protein  24.02 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 332 aa  48.1  0.0006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  23.99 
 
 		 475 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  22.22 
 
 		 614 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2671  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  29.41 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 783 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  27.67 
 
 		 272 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 		 473 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 450 aa  44.3  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1641  hypothetical protein  24.22 
 
 		 399 aa  44.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3878  serine/threonine protein kinase  23.61 
 
 		 396 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  26.67 
 
 		 320 aa  44.3  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 		 645 aa  43.9  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 		 1188 aa  43.9  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.18 
 
 		 553 aa  43.9  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>