38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3682 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  100 
 
 		 499 aa  1047    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  87.17 
 
 		 499 aa  946    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  86.97 
 
 		 499 aa  944    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  60.08 
 
 		 505 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  66 
 
 		 499 aa  743    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  59.84 
 
 		 498 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2989  serine/threonine protein kinase  38.57 
 
 		 472 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  29.88 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  25.56 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  27.41 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  29.73 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  24.7 
 
 		 1204 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  26.29 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  27.8 
 
 		 1121 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.99 
 
 		 682 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  25.51 
 
 		 709 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 		 581 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 1188 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_25974  predicted protein  38.46 
 
 		 733 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  24.67 
 
 		 605 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  24.86 
 
 		 663 aa  47  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  29.63 
 
 		 325 aa  47  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  24.46 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 1192 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  25 
 
 		 673 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 732 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7174  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 		 377 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00871383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  25.43 
 
 		 651 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48613  serine/threonine kinase  27.56 
 
 		 297 aa  44.3  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 		 1914 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 605 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  29.41 
 
 		 2279 aa  43.9  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 		 400 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 		 611 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>