46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1174 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  62.65 
 
 		 499 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1058    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  60.08 
 
 		 499 aa  647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  62.85 
 
 		 499 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  58.61 
 
 		 499 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  56.83 
 
 		 498 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2989  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 		 472 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  26.74 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  23.41 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  26.92 
 
 		 444 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  30.04 
 
 		 431 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  28.7 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  23.15 
 
 		 762 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.14 
 
 		 682 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  24.78 
 
 		 1204 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  27.27 
 
 		 1121 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  26.22 
 
 		 709 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  24.08 
 
 		 605 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3510  serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 581 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  36.11 
 
 		 2279 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 618 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 450 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 517 aa  47  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 1192 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 731 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68049  CDC5  25.45 
 
 		 666 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0168857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 611 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.35 
 
 		 1663 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  25.42 
 
 		 1668 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 1914 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 638 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2272 aa  44.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  29.17 
 
 		 651 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 		 542 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 		 605 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_25974  predicted protein  28.36 
 
 		 733 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3704  hypothetical protein  24.29 
 
 		 168 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140282  hitchhiker  0.000000146723 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  27.52 
 
 		 325 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 1188 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16067  predicted protein  28.16 
 
 		 264 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0854835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 		 502 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>