More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  100 
 
 
431 aa  897    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  34.05 
 
 
444 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  31.14 
 
 
452 aa  202  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2989  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
472 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  30.04 
 
 
505 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  30.3 
 
 
498 aa  90.9  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  27.48 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  27.1 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  27.41 
 
 
499 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  27.25 
 
 
739 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  27.25 
 
 
703 aa  71.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  22.82 
 
 
1121 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
447 aa  63.5  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
605 aa  63.2  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  28.1 
 
 
431 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
996 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 
575 aa  60.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  25.84 
 
 
464 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 
443 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  26.19 
 
 
443 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 
443 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
646 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3164  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 
682 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00493454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 
554 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  27.23 
 
 
475 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  30.28 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 
862 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 
1415 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  30.28 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 
1188 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  31.28 
 
 
1018 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 
577 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  25.48 
 
 
668 aa  56.6  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  23.91 
 
 
1122 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4058  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 
552 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.229235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.89 
 
 
825 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.32 
 
 
553 aa  56.6  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
604 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  31.21 
 
 
781 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2127  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.429011  normal  0.706941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0217  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00807707  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  31.96 
 
 
651 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0240  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0229  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 
562 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03940  kinase, putative  30.84 
 
 
882 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
567 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.19 
 
 
746 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
617 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  34.34 
 
 
352 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
503 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  24.23 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 
601 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  22.07 
 
 
565 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
597 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  24.27 
 
 
663 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 
557 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.41 
 
 
1044 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  24.31 
 
 
646 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
783 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  25.35 
 
 
625 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.65 
 
 
681 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.04 
 
 
528 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 
569 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
601 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 
641 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  28.39 
 
 
666 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0097  serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 
675 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255203  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
750 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 
666 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  27.48 
 
 
621 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
486 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  26.46 
 
 
565 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
624 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 
623 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  28 
 
 
1479 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
624 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  27.48 
 
 
623 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 
556 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
624 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.41 
 
 
1076 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  26.24 
 
 
595 aa  53.5  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.52 
 
 
635 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  26.54 
 
 
419 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 
624 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.64 
 
 
676 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.41 
 
 
1072 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 
593 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.92 
 
 
664 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
596 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 
610 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
713 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
647 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  25.35 
 
 
625 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  24.56 
 
 
484 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  23.59 
 
 
577 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.46 
 
 
587 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  25.65 
 
 
632 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>